Vượt Ngục (Phần 1) xoay quanh nhân vật chính là Michael Scofield (do Wentworth Miller thủ vai), một kỹ sư trẻ thông minh, bị kết án tử hình vì tội giết anh em của Tổng thống Hoa Kỳ. Tuy nhiên, anh ta tin rằng mình bị sai khiến và đã tìm cách lên kế hoạch để tẩu thoát khỏi nhà tù Sona. Để làm được điều này, Michael đã phải lên kế hoạch táo bạo, đó là cố gắng vào tù với tư cách một tù nhân bình thường, xây dựng các mối quan hệ với các tù nhân khác và đặc biệt là anh ta phải tìm cách lấy được bản thiết kế chi tiết của nhà tù để thực hiện kế hoạch.
